Předzpracování obrazu

předchozím článku jsme si ukázali, jak načíst lékařské snímky do MATLABu. Dalším krokem v pracovním postupu zpracování lékařských snímků je zpravidla předzpracování snímku za účelem následné segmentace. Hlavními cíli předzpracování a augmentace lékařských obrazů jsou redukce artefaktů a standardizace snímků v rámci celého souboru dat pro další zpracování. Kvalitu obrazu pro segmentaci lze zvýšit pomocí následujících operací:

Jak tyto operace provádět v prostředí MATLABu, si můžete přečíst v přehledovém článku v dokumentaci.

Odstranění lebky z MRI snímku mozku

Registrace obrazu

Další operací, která se při předzpracování obrazu využívá, je registrace. Tato operace slouží ke standardizaci prostorového zarovnání 2D nebo 3D lékařských snímků v datové sadě. Registrace může být užitečná pro porovnání snímků různých pacientů nebo snímků stejného pacienta pořízených v různých časech, na různých zařízeních nebo s použitím různých zobrazovacích metod. MATLAB poskytuje řadu vestavěných funkcí k provádění různých typů registrace – rigidní, afinní, translace…

Na tomto odkazu si můžete prohlédnout tabulku s přehledem vestavěných funkcí pro registraci, které naleznete v Medical Imaging Toolboxu.

Aplikace Medical Restration Estimator

V případě, že preferujete spíše práci s interaktivními nástroji, vyzkoušejte aplikaci Medical Registration Estimator (dostupná od verze R2024b). Aplikace umožňuje interaktivně registrovat 3D objemy (k interaktivní registraci 2D snímků slouží aplikace Registration Estimator). Objemy můžete ručně posunovat, otáčet a škálovat, abyste je zarovnali, nebo použít automatizované techniky rigidní a deformovatelné registrace. Můžete porovnávat různé techniky, ladit nastavení a vizualizovat registrované objemy jako 2D roviny řezů a 3D objemy. Aplikace poskytuje kvantitativní ukazatele přesnosti registrace a lze také exportovat registrovaný objem a transformační matici. Aplikace umožňuje také generovat kód s vybranou technikou registrace, který lze použít na jiné objemy mimo aplikaci.

Anna Tocháčková, 12.8.2025

close